Sisu

• Tarkvara ülevaade
• Toetatud failitüübid
• Esmane faililaiend
• Muud integreeritud genoomide brauseri poolt kasutatavad faililaiendid 9

Versioon (seisuga 6.9.2016)	9
Platvormid
Litsents	Avatud lähtekoodiga
Kategooria	Teaduslik

Rohkem infot (külastage avaldaja veebisaiti)

Hinnang: 2.8 / 5 (6 häält)

Tarkvara ülevaade

Põhijooned

• Toetab erinevaid genoomivorminguid, nagu GenBank ja FASTA
• Suunake andmete ja suumimise animatsioonidega
• Juurdepääs ja laadige genoomid QuickLoadi saitidest
• Muutke andmed erinevateks graafikuteks
• Jagage andmeid koostööpartneritega Dropboxi kaudu
• Installige lisandmoodulid lisafunktsioonide jaoks

Integreeritud genoomide brauser (IGB) on avatud lähtekoodiga programm, mida kasutatakse suurte genoomiliste andmekogumite vaatamiseks ja uurimiseks. Saate vaadata erinevaid andmevorminguid, suhelda oma andmetega, luua graafikuid, salvestada oma andmed piltidena ja jagada andmeid kaastöötajatega.

IGB võimaldab teil vaadata annotatsioonide ja joondatud järjestuste andmeid. Programm toetab erinevaid vorminguid, nagu FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband ja GenBank. Andmete erinevuste ja sügavuse graafikute esiletõstmiseks saate andmeid võtta ja muuta mitmesuguste graafikvormide vahel, sealhulgas mittevastavuse graafikud. Samuti saate oma andmetega suhelda IGB suumimise ja pildistamise animatsioonide abil.

IGB võimaldab teil pääseda juurde ja laadida genoome QuickLoad saitidest, mis on lihtsad kataloogid, järjestused ja muud andmefailid visualiseerimise eesmärgil. IGB pakub täiustatud funktsioone koos pluginatoetusega, et lisada skripte kasutades funktsionaalsust ja töövoo automatiseerimist. IGB annab teile ka täiustatud funktsioone oma andmete jagamiseks, olgu see siis, kui avaldate selle kõrgekvaliteedilise JPEG-, PNG- või SVG-pildina või salvestate andmeid Dropboxisse, et anda oma koostööpartneritele juurdepääs teie projektile.

IGB-d kasutavad peamiselt ülikooli teadlased, bioloogid ja bioinformaatikud. See pakub täiustatud vahendeid mitmesuguste genoomiandmete avamiseks, andmete visualiseerimiseks erinevate graafikutena ja andmete jagamist kaastöötajatega. Kahjuks toetub programm jätkuva arengu toetustele, mis tähendab, et taotluse toetamine võib igal ajal lõpetada. Integreeritud Genome Browser on siiski võimeline, kohandatav programm kasutajatele, kes soovivad oma genoomi andmeid uurida ja analüüsida.

Toetatud failitüübid

Esmane faililaiend

.XML - XML-fail

Muud integreeritud genoomide brauseri poolt kasutatavad faililaiendid 9

Toetatud failitüübid
.BED	UCSC BED märkuste jälgimise fail
.DAS	DeltaMaster analüüsi sessioon
.FA	FASTA vormindatud järjestuste fail
.FAS	FASTA järjestuste fail
.FASTA	FASTA järjestuste fail
.GB	GenBanki andmefail
.SGR	SGR genoomiandmete fail
.USEQ	USeqi genoomiandmete fail